MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 24052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	GTTT	2	8	111	118	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017551	CTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017551	T	7	7	189	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017551	TA	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017551	AG	4	8	222	229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017551	ATTC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017551	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017551	A	6	6	1697	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017551	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017551	AGT	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017551	TCA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017551	C	6	6	1928	1933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_017551	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017551	AGA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017551	CGA	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017551	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017551	GGTT	2	8	2058	2065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017551	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017551	T	9	9	2183	2191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017551	T	7	7	2231	2237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017551	AAG	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017551	TATAA	2	10	2310	2319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017551	CAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017551	TGA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017551	TTTA	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017551	ATG	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017551	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017551	TAAA	2	8	2533	2540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017551	TA	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017551	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017551	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017551	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017551	GTT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017551	AATT	2	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017551	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017551	ATT	2	6	2857	2862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017551	TA	3	6	2955	2960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017551	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017551	A	6	6	2991	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017551	AAAT	2	8	2999	3006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017551	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017551	GAAAA	2	10	3074	3083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017551	A	8	8	3094	3101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017551	TAC	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017551	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017551	TTAA	2	8	3192	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017551	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017551	TAT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017551	TAT	2	6	4357	4362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017551	ATA	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017551	TTTAA	2	10	4423	4432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017551	TAT	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017551	A	6	6	4567	4572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017551	TA	3	6	4602	4607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017551	A	7	7	4640	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017551	TTA	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017551	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017551	T	6	6	4851	4856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017551	TA	3	6	4993	4998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017551	A	6	6	12157	12162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017551	GGC	2	6	12196	12201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017551	CAT	2	6	12510	12515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017551	A	6	6	13413	13418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017551	T	6	6	13440	13445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017551	TCT	2	6	13463	13468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017551	T	6	6	13468	13473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017551	A	6	6	13509	13514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017551	GATT	2	8	13535	13542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017551	TAA	2	6	13586	13591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017551	CA	3	6	13622	13627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017551	ACT	2	6	13657	13662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017551	TTCT	2	8	13721	13728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017551	TTG	2	6	14649	14654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017551	A	8	8	14678	14685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017551	TGTA	2	8	14811	14818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017551	A	6	6	14870	14875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017551	ACA	2	6	14882	14887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017551	ACTT	2	8	14962	14969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017551	T	7	7	14984	14990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017551	A	7	7	14996	15002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017551	ACT	2	6	15011	15016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017551	ATA	2	6	15038	15043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017551	A	7	7	15063	15069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017551	A	6	6	15096	15101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017551	AT	3	6	15128	15133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017551	CTA	2	6	15732	15737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017551	A	6	6	15742	15747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017551	T	6	6	15778	15783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017551	T	6	6	19352	19357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017551	A	7	7	19401	19407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017551	GTT	2	6	19433	19438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017551	ATC	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017551	ATTTA	2	10	19462	19471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017551	T	6	6	19568	19573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017551	AAC	2	6	19574	19579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017551	TAA	2	6	19732	19737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017551	TTA	2	6	19784	19789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017551	TAAA	2	8	19846	19853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017551	T	7	7	19866	19872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017551	ATAAA	2	10	19891	19900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017551	AGATT	2	10	19909	19918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017551	GCCTT	2	10	20709	20718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017551	GTT	2	6	21653	21658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017551	TAT	2	6	21690	21695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017551	AAAG	2	8	21723	21730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017551	AT	3	6	21751	21756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017551	AGA	2	6	21761	21766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017551	A	6	6	21766	21771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017551	TA	3	6	23708	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017551	TTG	2	6	23720	23725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017551	AAC	2	6	23809	23814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017551	TGA	2	6	23817	23822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017551	T	7	7	23875	23881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017551	TAA	2	6	23897	23902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017551	TGTT	2	8	23993	24000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017551	A	7	7	24043	24049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017551	TCT	2	6	24104	24109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017551	TTATT	2	10	25847	25856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017551	AATT	2	8	25860	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017551	A	6	6	25902	25907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017551	TTC	2	6	25933	25938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017551	ACT	2	6	25949	25954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017551	ATG	2	6	26040	26045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017551	GAA	2	6	26074	26079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017551	T	6	6	26115	26120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017551	TGA	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017551	GAT	3	9	26201	26209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017551	TAG	2	6	26225	26230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017551	T	6	6	26291	26296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017551	TAAAA	2	10	26312	26321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017551	TAGT	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017551	ATT	2	6	26413	26418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017551	ATA	2	6	26578	26583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017551	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017551	AAT	2	6	26627	26632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017551	TAC	2	6	26654	26659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017551	TAT	2	6	26660	26665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017551	T	6	6	27047	27052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017551	TTCA	2	8	27078	27085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017551	TTA	2	6	27098	27103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017551	T	6	6	27113	27118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017551	ATA	2	6	27121	27126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017551	GTT	2	6	27149	27154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017551	AGAC	2	8	27220	27227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017551	ATT	2	6	27235	27240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017551	ACT	2	6	27293	27298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017551	TAT	2	6	27355	27360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017551	ACTAA	2	10	27361	27370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017551	TTAA	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017551	ATA	2	6	27417	27422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017551	A	6	6	27469	27474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017551	TAAT	2	8	27814	27821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017551	TTA	2	6	27885	27890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017551	ATTTT	2	10	100496	100505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017551	T	7	7	100502	100508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017551	AAT	2	6	100550	100555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_017551	GC	3	6	100642	100647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_017551	ACG	2	6	101712	101717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_017551	AATT	2	8	103153	103160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017551	CTA	2	6	103209	103214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_017551	CAA	2	6	103225	103230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_017551	TAT	2	6	103234	103239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017551	ATTT	2	8	103269	103276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017551	T	6	6	103318	103323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017551	TA	3	6	103327	103332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017551	A	6	6	103430	103435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017551	TA	3	6	104060	104065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017551	TAAAA	2	10	104105	104114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017551	TTC	2	6	104149	104154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_017551	T	7	7	104158	104164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017551	ATT	2	6	104211	104216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017551	TACT	2	8	104233	104240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
472	NC_017551	TCA	2	6	104261	104266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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474	NC_017551	T	6	6	104338	104343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017551	ACA	2	6	104378	104383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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478	NC_017551	CGTA	2	8	104471	104478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
479	NC_017551	T	6	6	104504	104509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017551	TAG	2	6	104552	104557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_017551	TATT	2	8	104715	104722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_017551	TTA	2	6	104748	104753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_017551	T	7	7	104802	104808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_017551	ATT	2	6	104848	104853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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